閉式系統管道中又經常充滿滅火介質，免不了偶有泄漏，污染空氣，所以自動滅火系統不宜用于潔凈廠房裝修。
自動消防設施的設計：
潔凈廠房為防止灰塵飛散，空氣凈化一般采用上送下回或水平強制氣流送風的換氣形式，它的回風口往往設置在靠近地面處，這使得在火災初期、空氣凈化系統 尚未停止工作的情況下，用安裝在吊頂上的普通感煙探測器來探測火災信號，往往起不到及早預警的效果。所以，對于火災自動報警系統探測器的選型，不適合用感 煙型探測器。如必須要用時，應對感煙型探測器的安裝方式、安裝部位進行合理的設計。
廠房內的疏散設計：
廠房內部的疏散通道應力求簡捷，避免迷宮式、門中門的布置法。對于廠房的出入口設計，出入路線盡可能筆直。如特殊工藝需要，出入口不能滿足人員疏散 時，應將疏散通道局部靠外墻，在局部靠外墻處用封閉鋼化玻璃門作為緊急疏散出口，并在固定玻璃門處設安全出口燈和擊碎玻璃用的橡皮錘。通道上疏散指示標志 宜選用燈光疏散指示標志，其設置部位要根據潔凈廠房特殊的通風排煙形式而定。一般的潔凈廠房通風排煙大多為上送下回形式，所以設置部位宜考慮采用上部和下 部穿插設置。
通風排煙設計：
對于廠房內某些工段使用易燃易爆化學危險物品或中間產品有易燃易爆氣體和有毒氣體的，該區域應單獨設置事故排風系統，并能與送風系統相互切換。設有中 央空調系統或送回風系統的廠房，應在疏散走道、值班室和經常有人的車間設置緊急切斷按鈕，切斷其送風和回風，以防止火勢加速蔓延。在疏散走道、人員密集的 車間和重要的控制室應設置排煙系統，以利于人員的疏散和搶險救援。
設計好廠房的平面布置：
在廠房建設之前，應由設計單位、建設單位、使用單位、設備安裝或供應單位對廠房內部布置先期進行論證。首先應考慮將易燃易爆的工藝或設備間盡可能布置 于廠房外或與廠房貼鄰，如有困難或工藝需要必須布置于廠房內的，應靠外墻設置并與廠房的其他功能區用實體墻分隔，以便于采取防火防爆措施。其次，將裝配車 間、包裝車間等人員密集部位靠近外墻，并確保有一長邊是廠房的外墻，一方面便于開設緊急疏散出口，另一方面利于事故時的排煙和救援。
建筑構件及內裝修：
建筑應盡可能地采用磚混結構，如用鋼結構時，其廠房各構件耐火極限應能達到二級耐火等級的要求。廠房的保溫材料應盡可能選用不燃或難燃材料，并盡量避 免采用泡沫塑料、橡膠或其他多孔的有機高分子材料。對于廠房的內部裝修，因為其構造上的封閉性和疏散、排煙上的不利性，與地下民用建筑火災危險性等級相 近，所以其各部位的裝修要求宜按《建筑內部裝修設計防火規范》中地下民用建筑的要求執行。
潔凈廠房要求有良好的封閉性，與外界盡量隔離，以實現廠房內潔凈度的要求，所以在任何與外界相通的地方都采取了相應的隔離措施。首先是廠房入口，需通 過更衣室、除菌室、準備室等才能進入到工作間內，并且各工作間又是相互分隔，門中有門。這些多門出入、門中門的設計延長了人員的疏散時間。其次，為了減少 外界灰塵及氣溫對廠房內的影響，廠房的外墻一般開窗、設門較少，疏散較為困難。第三，大部分醫藥、電子、食品類潔凈廠房屬于勞動密集型廠房，特別是包裝車 間、裝配車間等，大多是車間小、人員多，極易造成群死群傷的惡性事故。
